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基因数据处理46之cloud-scale-bwamem安装(compile.pl安装没问题
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:167
版本:https://github.com/ytchen0323/cloud-scale-bwamem/releases/tag/v0.2.1 1.需要设置spark路径: !--systemPath/cluster/spark/spark-1.3.1-bin-hadoop2.4/lib/spark-assembly-1.3.1-hadoop2.4.0.jar/systemPath -- systemPath/home/hadoop/cloud/sp[详细]
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基因数据处理44之cloud-scale-bwamem安装
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:66
cloud-scale-bwamem是在spark等云环境上实现bwa-mem算法,加速对全基因组匹配的处理 1.下载: git clone https://github.com/ytchen0323/cloud-scale-bwamem.git 2.编译: mvn clean package 3.编译成功: [INFO] ---------------------------------------[详细]
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基因数据处理50之cs-bwamem、bwa、snap、bwa-mem与art比较
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:107
副标题#e# 直接看结果: (1)art仿真数据: hadoop@Master:~/cloud/adam/xubo/data/GRCH38Sub/cs-bwamem$ cat G38L100c50Nhs20.aln ##ART_Illumina read_length 100@CM art_illumina -ss HS20 -i GRCH38chr1L3556522.fna -l 100 -c 50 -o G38L100c50Nhs20[详细]
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基因数据处理45之cloud-scale-bwamem安装(compile.pl安装有问题
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:67
脚本: hadoop@Master:~/xubo/tools/cloud-scale-bwamem$ cat compile.pl #! /usr/bin/perlsystem "mvn clean package";chdir "./src";system "mvn package -PotherOutputDir";chdir "./main/jni_fpga";system "mvn package -PotherOutputDir";chdir "../a[详细]
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基因数据处理47之ART基因序列数据生成器(仿真)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:196
1.概念: ART基因序列数据生成器 详细请见论文:【1】 和官网【2】 2.下载: ART-bin-GreatSmokyMountains-04.17.16-Linux64.tgz http://www.niehs.nih.gov/research/resources/assets/docs/artbingreatsmokymountains041716linux64tgz.tgz 3.配置 sudo cp[详细]
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基因数据处理49之cloud-scale-bwamem运行成功
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:64
副标题#e# 1.先使用art生成数据: 请看前一篇 2.上传fastq到hdfs: hadoop@Master:~/cloud/adam/xubo/data/GRCH38Sub/cs-bwamem$ spark-submit --class cs.ucla.edu.bwaspark.BWAMEMSpark --master local[2] /home/hadoop/xubo/tools/cloud-scale-bwamem-0.[详细]
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基因数据处理48之ART使用实例
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:149
副标题#e# 相关参数请见上一篇 1.使用实例1: hadoop@Master:~/cloud/adam/xubo/data/GRCH38Sub/cs-bwamem$ art_illumina -ss HS20 -i GRCH38chr1L3556522.fna -l 100 -f 20 -o G38L100F20Nhs20 ====================ART==================== ART_Illumina[详细]
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求0至大数之间的随机数
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:104
题目:给定一个String类型的大数(非负整数),不能直接转化为Integer,类似如下要求 The numbers can be arbitrarily large and are non-negative. Converting the input string to integer is?NOT?allowed. You should?NOT?use internal library such as?B[详细]
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数据处理---Spring Batch之实践
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-01 热度:163
副标题#e# 上面介绍了Spring Batch的基本概念和简单的demo项目,显然这些还是不够实际使用的。下面我们来更多的代码实践。 ? ? ? ? 在上面的基础项目上面,我们来更多的修改: ? ? ? ? 不用项目默认的hsql DB,用mysql,让ItemReader,ItemWriter 支持mysql;[详细]
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Pentaho BI Server的启动过程详解(二)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-01 热度:70
时隔好久现在接着上一篇来继续聊一下Pentaho BI Server的启动过程,今天主要讲的就一个类PentahoSystem。 软件版本 Pentaho BIServer 5.0.1-ce 关于PentahoSystem 在上一篇文章里已经介绍过在SolutionContextListener中当应用启动时分调用PentahoSystem的i[详细]
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【最强干货】关于文本挖掘的资料(文献,报告,策略,代码)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-01 热度:131
副标题#e# 查看之前文章请点击右上角 ,关注并且 查看历史消息 所有文章全部分类和整理 ,让您更方便查找阅读。请在页面菜单里查找。 今天没有策略研究推送。 有几篇文章还需再研究一下 好久没有给大家干货啦 今天给大家一些干货福利 文本挖掘方面的资料 文[详细]
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暴力:大数加法
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-01 热度:68
Description The I-number of x is defined to be an integer y,which satisfied the the conditions below: 1. yx; 2. the sum of each digit of y(under base 10) is the multiple of 10; 3. among all integers that satisfy the two conditions above,[详细]
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数据处理---Spring Batch之进阶
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-01 热度:185
有了前面两篇的基础之后,我们一起来聊聊更高级的关于Spring Batch的话题。比如Job 配置;自定义各种Listener;控制步骤流程;自定义Reader,Processor,Writer;并行处理。这些东西在Spring Batch的使用中很多可能会需要的,当然还有更多的内容,最好找下文[详细]
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什么是BI ? 哪些行业需要用到BI?
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-01 热度:57
什么是BI?哪些行业需要用到BI? BI——就是分析利用企业已有的各种商用数据来了解企业的经营状况和外部环境,从而为企业的经营决策提供数据支撑。 下面我们来详细分解下: 企业应用BI的目标即是期望通过对来自不同的数据源进行统一处理及管理,把数据变成[详细]
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[每月好书] 写给大家看的算法书(来自漫画帝国的图解算法书:轻
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-01 热度:124
副标题#e# 和老规矩一样,本月月考的奖品就是《写给大家看的算法书》两本。不知道什么是月考的同学,请补习下面文章: 每月送书活动来袭,免费哦! 另外,为了避免每次月考都是相同的同学获得最高奖,从上次月考开始,获得过最高奖(得到过书)的同学,将不能[详细]
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斯特林大数公式求阶乘位数
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-01 热度:91
? 题目链接: ? ? ? ? ? ? ? FZU: ? ?-?Link?- ? ? ? ? ? ? ? NYOJ ? ? ??? ? ?无意在FZU上看到这道题,以前在NYOJ上做过不过又忘了怎么做了; ? ?网上找找才记起来这个斯特林大数公式;log(n!)=log10(sqrt(2*pi*n))+n*log10(n/e)+1; ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?[详细]
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同义词挖掘
所属栏目:[大数据] 日期:2021-02-28 热度:184
词典百科词条 1:规则提取数据,对于一些别名,或者关键词括弧类的数据,或者简称等. 2.提取简要关键词,计算夹角余弦. 上下文相关性挖掘(需要人工审核) 在所有的文档中,如果两个term经常在相同的上下文下出现,那么这两个词是同义词的可能性较大。基于这个假[详细]
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电商卷皮BI的实践演进和架构体系—猫友会大讲坛第4期
所属栏目:[大数据] 日期:2021-02-28 热度:71
副标题#e# 大家好,我是卷皮BI团队负责人柴楹,今天在这里给大家分享一下卷皮的BI和大数据的一些东西。 BI大数据是什么? 首先我们来聊一下BI和大数据。BI和大数据到底有什么关系和不同。 BI主要有三方面的技术,包括 DW,OLAP,DM。目标就是提高企业经营和[详细]
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搞得定基因组分析的TB级数据处理,跑的赢摩尔定律的发展边际,劲
所属栏目:[大数据] 日期:2021-02-28 热度:139
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手把手教你从0到1构建大数据分析平台(仅剩18个名额)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-02-28 热度:80
副标题#e# StuQ?联合三位大数据资深专家桑文锋、曹犟、付力力共同推出《从0到1构建大数据分析平台》精品小班教学,仅有 60 席位,精品小班课区别于大众在线视频教学,课程设置具有如下特色: 采用在线视频直播授课 以实战为主 在线解答疑问 课后作业review[详细]
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【企业推荐】蚁坊软件-专业从事互联网大数据分析
所属栏目:[大数据] 日期:2021-02-28 热度:57
副标题#e# 大 数 据 人 报道DT时代应用资讯及动态,爆料剖析行业热点新闻 本文系蚁坊软件投稿于大数据人发布。欢迎更多优质原创文章投稿给大数据人:289585305@qq.com 湖南蚁坊软件有限公司 一、公司介绍 1、公司简介 湖南蚁坊软件有限公司成立于2010年8月[详细]
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大数相减-c++
所属栏目:[大数据] 日期:2021-02-28 热度:98
/*题目:输入两行字符串正整数,第一行是被减数,第二行是减数,输出第一行减去第二行的结 /果。 /大数一般会超出长整型的范围,所以用字符串存储数据然后按照减法运算法则实现就成了。 /string类成员函数功能强大! */ #include iostream#includestringus[详细]
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大数乘法,大数加法,大数减法
所属栏目:[大数据] 日期:2021-02-28 热度:58
#include iostream #includecstring using namespace std; class MData { private: int n,m; char *str1,*str2; public: char *mul();//乘法 char *add();//加法 char *sub();//减法 char *div();//除法 MData(); MData(const char *s1,const char * s2);[详细]
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大数据预测欧洲杯决赛:C罗成法国夺冠最大变数
所属栏目:[大数据] 日期:2021-02-28 热度:132
本文首发于公众号 足球魔方(ID:zuqiumofang),由 足球魔方 授权 大数据 转载。如需转载请与作者联系,谢绝二次转载。 足球魔方数据研究院 重磅推出 欧洲杯决赛大数据前瞻 7月8日凌晨,欧洲杯半决赛东道主法国队以2-0完胜德国,昂首晋级后将在圣但尼-法[详细]
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数据处理之标准化/归一化方法
所属栏目:[大数据] 日期:2021-02-28 热度:112
数据处理之标准化/归一化方法 归一化方法(Normalization Method) 1.把数变为(0,1)之间的小数 ? ? ? 主要是为了数据处理方便提出来的,把数据映射到0~1范围之内处理,更加便捷快速,应该归到数字信号处理范畴之内。 2.把有量纲表达式变为无量纲表达式[详细]
